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股權轉讓被稅務稽查需要關注的六種情形
一、未稅務申報
發生股權轉讓行為但不申報交納相對應稅款，股權轉讓兩方應屬不繳應納稅款的偷稅行為，將會受到相對應稅務處罰，被投資企業若未履行報送材料的義務，亦有可能受到行政處罰。
1、股權受讓方
股權受讓方作為簽署股權轉讓協議的一方主體，依規依法應屬印花稅的納稅主體要依法申報并繳納印花稅，未按期申報并繳納的將受到補繳應納稅款并被處以罰款的行政處罰；其同時作為股權出讓方繳納個人所得稅的扣繳義務人，未履行扣繳義務，未按期申報的，根據《中華人民共和國稅收征收管理法》及其實施細則有關規定將受到行政處罰，可能被處以未申報稅款罰款處罰。
2、股權出讓方
股權出讓方作為簽署股權轉讓協議的一方主體，依規依法應屬印花稅的納稅主體要依法申報并繳納印花稅，未按期申報并繳納的將受到補繳應納稅款并被處以罰款的行政處罰；其同時作為股權出讓方繳納個人所得稅的納稅主體，未履行納稅申報義務，未按期繳納稅款的，將受到補繳相對應稅款并處以罰款的行政處罰。
3、被投資企業
被投資企業在其自然人股東發生變化時具有履行報送相關資料的義務。根據《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法（試行）》第二十二條第一款“被投資企業應當在董事會或股東會結束后5個工作日內，向主管稅務機關報送與股權變動事項相關的董事會或股東會決議、會議紀要等資料?！?/p>
二、股權轉讓價款存疑
根據實踐經驗，股權轉讓價款存疑可能表現為0元轉讓、1元轉讓、等額轉讓、企業盈利但轉讓價格不合理的折價轉讓、同一企業短期內股權轉讓存在較大差異等情形，若股權轉讓價款存疑，可能引發稅務機關核定征收的情形。
三、虛假稅務申報、提供資料不完整
納稅人存在虛假稅務申報，辦理股權轉讓納稅或扣繳申報時提供的資料不完整，引發稅務機關合理懷疑的將可能成為稅務稽查重點對象，如不能提供完整且準確的股權原值證明材料；提供的股權轉讓合同內容可能引發偷逃稅款合理懷疑的，如載明“兩方實際股權轉讓價款以實際付款為準”等內容；依規依法應當進行資產評估但未能提供或拒不提供有效的資產價值評估報告的；股權轉讓價款明顯偏低但不能提供有效的證明材料等情形。
四、頻繁股權轉讓行為
根據《股權轉讓所得個人所得稅管理辦法（試行）》，各地稅務機關加強個人股權轉讓的動態管理，建立股權轉讓個人所得稅電子臺賬，將自然人股東的相關信息錄入征管信息系統，強化對每次股權轉讓間股權轉讓收入和股權原值的審核，同時伴隨個人股權轉讓信息自動交互機制在全國范圍的廣泛推行，同一自然人股東在一定期限內頻繁發生股權轉讓行為或同一企業或關聯企業的股權一定期限內頻繁被轉讓的，將被識別并作為稅務稽查重點對象。
五、企業發生注冊資本變動
當企業發生注冊資本變動時，可能涉及引入投資者導致注冊資本增加亦可能通過資本公積轉增股本，或企業減少注冊資本時，可能引發自然人股東個人所得稅納稅義務的產生，因此當企業注冊資本發生變化時，可能成為稅務稽查的重點對象。
如北京某企業股本由875萬元增加至7000萬元，6125萬元為資本公積轉增股本，有7名自然人股東的股本由540萬元增加到4320萬元，但無交納相關個人所得稅的記錄?；榫謱Χ悇盏怯浿凶再Y本增加沒有繳納印花稅記錄的企業開展約談時，發現該企業上述情況。企業認為：按照198號文件規定的“股份制企業用資本公積金轉增股本，不屬于股息、紅利性質的分配，對個人取得的轉增股本數額，不作為個人所得，不征收個人所得稅”，以及289號文件關于“‘資本公積金’是指股份制企業股票溢價發行收入所形成的資本公積金。
該轉增股本的資本公積，應屬股本溢價發行形成的資本公積，不應繳納個人所得稅。檢查人員檢查發現，該企業資本公積形成于2013年，是一家醫藥公司直接股權投資形成的，沒有股票發行過程，應屬投資者投入形成的資本公積增加，而非股票溢價發行形成，不符合上述文件的要求，應繳納個人所得稅，最終做出補繳個人所得稅756萬元，罰款378萬元的處罰決定。
六、交易雙方因股權轉讓發生糾紛
交易雙方因股權轉讓事宜發生糾紛，引發訴訟或仲裁時，可能導致稅務機關對該股權轉讓行為的重點關注。
隨著稅收征管的深化改革，稅務機關與工商部門逐步落實和完善股權信息交換制度，個人股權轉讓信息自動交互機制的廣泛推行，納稅人想要通過不稅務申報逃避稅款目的將無法實現，否則將面臨雖轉讓股權但不辦理變更登記的法律風險。
